دبیرخانه شورا در سازمان استان مستقر است و وظایف آن به شرح زیر است:
الف - تهیه دستور کار و برنامه زمانبندی تشکیل جلسات شورا، مطابق تبصره (۵) بند (الف) ماده (۳۱) قانون با هماهنگی رییس شورا.
ب - ارسال تصمیمات شورا حداکثر ظرف یک هفته پس از تشکیل جلسه برای اعضا و دستگاههای اجرایی ذیربط استان.
پ - ارایه گزارشهای ارزیابی مستمر، پیگیری مصوبات شورا، تهیه گزارشهای فصلی و سالانه از عملکرد شورا و کارگروهها و ارسال آن به استاندار و اعضای شورا.
ت - بررسی پیشنهادهای کارگروهها و کمیتهبرنامهریزی شهرستانها و آمادهسازی آنها برای طرح و تصویب در شورا.
ث - پیگیری تهیه و هماهنگی برنامههای یکساله کارگروهها.
ج - سایر موارد ابلاغی از سوی شورا در چهارچوب قوانین و مقررات و اسناد بالادستی.
تبصره - مسئولیت هماهنگی، نظارت و پیگیری انجام وظایف و ارزیابی عملکرد شورا بر عهده سازمان خواهد بود.